A mon avis, il va falloir scripter un peu pour faire ça. Heureusement il existe pas mal d’outils pour t’aider à faire les taches les plus pénibles :-)
Première étape: télécharger tes PDFs en local, avec le logiciel de synchro de Google Drive.
Si ton PDF a besoin d’un coup d’OCR, tu peux utiliser l’outil gratuit de google: tesseract-ocr. Sinon tu peux utiliser un parseur de contenu PDF comme pdfreader (module npm/node.js que j’ai développé pour ça).
Ensuite tu pourrais utiliser un autre module npm (comme google-spreadsheet-append-es5, dont je suis aussi l’auteur) pour stocker tes données extraites dans Google Spreadsheet.
En espérant que ça t’aide !